安装双硬盘后，读者会发现第一个硬盘（以下简称Disk1）的C盘还是C盘，不过Disk1的D盘在新系统中却变为E盘，E盘变成F盘...而第二个硬盘（以下简称Disk2）的C盘则变为新系统的D盘，Disk2的D盘、E盘等逻辑盘就排在Disk1所有盘符之后。这种情况称为盘符交错现象。

　　双硬盘的盘符交错问题是因为MS－DOS对硬盘的管理方法造成的。MS－DOS把第一个物理硬盘的激活DOS分区叫做C，第二个物理硬盘的有效的激活DOS分区叫做D，第一个物理硬盘的扩展DOS分区叫做E、F等等，剩下的字母分配给第二个物理硬盘的扩展DOS分区。如果没有第二个物理硬盘，或第二个物理硬盘没有基本DOS分区，那么D就分配给第一个物理硬盘的扩展DOS分区的第一个逻辑驱动器了。

　　盘符交错现象会产生一系列问题，最常见的就是某些软件因为盘符变化而导致路径错误，在启动该软件时需要重新确认文件路径。要避免盘符交错现象，对于Windows 95/98系统来说，最简单的方法莫过于利用它的“即插即用”功能。即在BIOS中将第二硬盘设为None，开机后，Windows 95/98的“即插即用”功能就可以提示检测到新硬件，并自动分配盘符给它，此时盘符的分配和很多人的期望就一致了。由于原来主硬盘上的所有软件所在的盘符都没有变化，因此在硬盘上的软件可以照常运行，盘符交错问题也就解决了。